內容簡介
本外掛解析 [aexp] 短碼以從 ArrayExpress XML API 中提取和顯示元數據。
正確的短碼格式是 [aexp = "id"]metadata[/aexp]
其中 id 是您要查詢的 ArrayExpress 物件的存取編號，而 metadata 則是下列類型之一：
species ：返回物種信息
accession ：返回關聯存取編號
submissiondate ：返回提交日期
lastupdate ：返回最後更新日期
releasedate ：返回發行日期
name ：返回實驗簡短描述
description ：返回實驗詳細描述
score ：返回 MIAME 分數（滿分為 5 分）
contact ：返回聯繫人電子郵件地址和職務（如提供）
citation ：返回引文、發表信息和 PubMed 鏈接（如果提供）
datafiles ：返回原始數據文件、處理後數據文件、SDRF 文件和 IDF 文件的鏈接
png ：返回并連接實驗設計 PNG 圖像
svg ：返回并連接實驗設計 SVG 圖像
assays ：返回測試次數
samples ：返回樣本數
arraydesign ：返回並連接陣列平台
experimenttypes ：返回實驗類型（時間序列數據、aCGH、染色體互換等）
experimentalfactors ：返回實驗因素（藥物劑量、時間點、基因型、化合物等）
sampleattributes ：返回樣本屬性（器官部位、發育階段、組織來源、性別、株系等）
版權
本插件版權為 Newcastle University 的 Daniel Swan 所有，根據 GPLv2 許可文件進行許可。
外掛標籤
開發者團隊
原文外掛簡介
Interprets the [aexp] shortcode to extract and display metadata from the ArrayExpress XML API.
The correct shortcode format is [aexp = “id”]metadata[/aexp]
Where id is the accession number of the ArrayExpress holding you wish to interrogate and metadata is one of the following types
species : returns species
accession : returns linked accession
submissiondate : returns submission date
lastupdate : returns last update date
releasedate : returns release date
name : returns short experiment description
description : returns long experiment description
score : returns MIAME scores (out of 5)
contact : returns contact email address and role if supplied
citation : returns citation, publication information and link to PubMed if supplied
datafiles : returns links to raw and processed data files, sdrf and idf files
png : returns and links the experimental design png
svg : returns and links the experimental design svg
assays : returns the number of assays
samples : returns the number of samples
arraydesign : returns and links to the array platform
experimenttypes : returns the experiment types (time course data, aCGH, dye swapped etc.)
experimentalfactors : returns the experiment factors (drug dose, timepoints, genotypes, compounds etc.)
sampleattributes : returns the sample attributes (organism part, developmental stage, tissue source, sex, strain etc.)
Copyright
This plugin is copyright Daniel Swan, Newcastle University and is licensed under GPLv2.
